РЕШЕНИЯ КИНК - АНТИКИНК ДЛЯ ДВИЖЕНИЯ НУКЛЕИДА В ПОЛЕ ПОТЕНЦИАЛА В ПРОГРАММЕ PYTHON
DOI:
10.26577/JPEOS.2024.v26-i2-a8Ключевые слова:
Модель Инглендера, физика ДНК, плотность энергии кинк-антикинка, программное обеспечение Python, деформация.Аннотация
Данная статья посвящена исследованию модели Инглендера в потенциальном поле. В модели нуклиды представлены в виде маятника, соединенного общей нитью. На основе модели Инглендера исследовано уравнение синус-Гордона, описывающее нелинейные системы. Рассмотрены новые нелинейные модели Пейрар-Бишопа, модели Поланд-Шерага, Якушевича и Скотта. С использованием модели Инглендера функциональность молекулы ДНК как графическая структура. В основе структурных изменений в модели Инглендера лежит кинк и антикинк. Рассчитаны аналитические и численные значения характеристик. Показано, как топологические аспекты используются в нелинейных моделях молекулы ДНК. Описана сложная динамика ДНК и ее топологические дефекты. Рассмотрено моделирование динамического процесса во время транскрипции или репликации путем применения уравнения ДНК. Используя параметры ДНК, решения уравнения получаются в виде кинка и антикинка. Найдена плотность энергии кинка и антикинка. Построены кривые плотности и поверхности кинк и антикинков. Для поиска решений дифференциальных уравнений используется метод разделения переменных. С помощью программного обеспечения Python получены 2D и 3D графики взаимодействия кинков-антикинков.


